Цей практичний курс надає підготовку з біоінформатичного аналізу експресії генів, зосереджуючись на аналізі РНК-секвенування з використанням R, R Studio та різних пакетів R. Крім того, курс знайомить з основними концепціями аналізу РНК-секвенування поодиноких клітин.
Всі наші викладачі є практикуючими біоінформатиками, які виконують біоінформатичні аналізи в рамках своїх робочих обов'язків або академічних досліджень. Їхній досвід викладання ґрунтується на їхній професійній діяльності та попередньому досвіді викладання на курсах НУО "Геноміка UA".
Кожне заняття складається з 30-хвилинної вступної лекції та 90-хвилинного практичного заняття. Під час цих занять студенти будуть займатися аналізом реальних даних під керівництвом інструктора, брати участь в інтерактивному оцінюванні та матимуть можливість ставити запитання.
Курс починається з R boot camp, який знайомить новачків з мовою програмування R та R Studio, а також слугує повторенням для тих, хто вже знайомий з R. Після цього курс охоплює низку тем, включаючи основи аналізу експресії генів, просунуті підходи до роботи з R, диференціальний аналіз експресії за допомогою DESeq2, візуалізацію даних, функціональний аналіз та аналіз транскриптомів поодиноких клітин.
Курс завершується підсумковим оцінюванням у формі тестів з декількома варіантами відповідей.
Крім того, курс включає командний проект, в якому студенти аналізують дані експресії з загальнодоступного набору даних, починаючи з матриці прочитань. Викладачі надають набір даних та об'єднують студентів у невеликі групи по 2-3 учасники. Кульмінацією курсу є дві заключні сесії, зосереджені на студентських презентаціях та зворотному зв'язку від викладачів. Хоча ці міні-проекти не оцінюються, успішні команди отримають додаткові сертифікати від ГО "Геноміка UA", підписані викладачами.
Всі тренінги проводитимуться українською мовою, але оскільки біоінформатика документується англійською мовою, а в цій галузі використовується усталена англійська термінологія, на кожній сесії буде надано необхідну довідкову інформацію.
Тривалість курсу - 30 годин.
Очікувана кількість учасників – 50.
Стипендія: 25 стипендій по 200 євро. Для студентів з родин, що сильно постраждали від війни.
Реєстрація до 23 липня 2024 включно.
Детальніше